La biblioteca è collocata all’interno del Palazzo Arcivescovile, ubicato accanto al Duomo nell’omonima piazza del centro storico dell’isola di Ortigia. Prende il nome dal suo fondatore Giovanni Battista Alagona, vescovo di Siracusa nella seconda metà del XVIII secolo.
Nella sala lignea sono conservati preziosi testi antichi, tra i quali 21 codici latini, greci e arabi. tra di essi vanno segnalati un Corano commentato, le “Istituzioni di rettorica” del celebre umanista Giorgio Trapezunzio(1397-1486), un “evangeliario” greco, il “Libro d’Ore della Beata vergine Maria” con moltissime miniature di stile fiammingo (sec. XIV) e una pregevole Bibbia in caratteri gotici. Le più antiche edizioni a stampa sono rappresentate da una ricca collezione di 70 incunaboli dal 1470 al 1500. Da segnalare un bellissimo esemplare “Liber Cronicarum” di Scherer e Komermeister, nella impareggiabile edizione norimberghese del Koberger (1493), la nota “Biblia pauperum” e il “Manipulus curatorum” di Giovanni Bellem da Brema.
