Le vicende legate all'edificio sono piuttosto complesse: nel 1512 il podestà Giovanni Summo deliberò l'erezione di un edificio a spese della comunità: il terreno di proprietà del parroco, Paolo Omodei, fu acquistato e quale progettista fu scelto Agostino de Fondulis. La posa della prima pietra è datata 11 maggio 1513, esattamente due anni dopo la prima apparizione. Seppur ancora incompleto, nel 1516 l'edificio fu consacrato, ma è solo con il termine della costruzione della cupola, nel 1525, che la costruzione poté dirsi conclusa.

Nel 1528 la chiesa fu assediata dalle truppe del duca di Brunswick con conseguenti gravi danni: vennero bruciati gli arredi, devastati gli interni e distrutti gli ex voto. Campanile e sagrestia furono aggiunti nel 1573.