Il Museo è ospitato all’interno del complesso del Palazzo d’Avalos, edificio di grande valore storico e architettonico. Il museo conserva e valorizza importanti testimonianze del passato della città e del territorio dei Monti Dauni, offrendo un percorso che abbraccia l’archeologia, la storia e l’arte sacra.
Tra le collezioni più significative si trovano reperti provenienti da insediamenti preromani e romani, documenti e manufatti medievali, nonché opere legate alla cattedrale romanica di Troia, celebre per il suo rosone in pietra. Il museo svolge anche un ruolo educativo e culturale, promuovendo mostre temporanee, attività didattiche e iniziative volte alla tutela e alla diffusione del patrimonio storico locale.