Il Museo raccoglie al suo interno una importante collezione di fossili del fluminese. La struttura museale risulta inadeguata ad accogliere i visitatori e di conseguenza è mal gestita, ma nostante ciò la collezione paleontologica merita di essere vista. Infatti è possibile ritrovare tra le teche impolverate importanti campioni di Trilobiti, Cruziane, Bilobiti, Cardiole, articoli di Crinoide, Archeociatine, teche di Cistoide, scisti ad Orthis ma soprattutto campioni in matrice e singoli di Orthoceras; ovvero la fauna marina che popolava i mari paleozoici della Sardegna.