Ospitato presso Palazzo Pisani, sede del Conservatorio di Musica "Benedetto Marcello", in quello che era l'appartamento nuziale di Alvise Pisani, edificio risalente agli inizi del ‘600 e terminato nel 1728. Il restauro degli ambienti che ospitano la collezione ha fatto emergere una fitta simbologia alchemico-massonica che lascia intravedere, in una delle stanze adiacenti al museo, la struttura architettonica di un tempio massonico.

Il museo degli strumenti musicali comprende, oltre a vari preziosi strumenti antichi, alcuni oggetti donati da R. Wagner e gli autografi dell’ultima opera letteraria di Benedetto Marcello, cimeli, quadri, fotografie d'epoca e spartiti autografi.