Ubicato all'interno di Palazzo Rogadeo, il museo espone reperti archeologici protostorici, preclassici e classici, come i crateri a campana apula a figure rosse del IV secolo a.C. La collezione numismatica comprende monete greche, romane, bizantine, medievali e moderne. Nel museo si può ammirare una rara riproduzione miniata della Bibbia di Borso D’Este, rilegata in pelle con guarnizioni in filigrana d’oro e argento.
Pregevole il patrimonio custodito dalla Biblioteca che annovera incunaboli, cinquecentine e pergamene.