Il Museo diocesano e del Codex racchiude al suo interno due musei, quello diocesano e quello del Codex. All'ingresso il visitatore troverà un corridoio, dove sulla parete di fondo avrà modo di vedere un video introduttivo che accoglierà il visitatore e spiegherà i contenuti stessi del museo. Il corridoio è direzionale: a sinistra si va nelle sale riservate al Codice Purpureo, tre sale, a destra il restante Museo diocesano di Rossano, composto da sei sale espositive dove in ognuno è possibile rivivere le fasi storiche della diocesi e del suo territorio.

Il museo conserva inoltre circa duecento opere d'arte di varie epoche e di varia natura appartenute a diverse chiese dell'arcidiocesi di Rossano-Cariati.