Il Museo si articola in sette diversi percorsi nella struttura ex-conventuale e raccoglie testimonianze religiose di arte contemporanea dal 1949 a oggi, realizzate da artisti di rilievo nazionale e internazionale; attualmente sono presenti nella collezione 113 opere di 79 artisti. In dialogo con il patrimonio storico-artistico della la Chiesa Monumentale di S. Maria La Nova (XV sec.) gli artisti si confrontano col tema della ricerca religiosa nel senso più ampio del termine e in una prospettiva di confronto interreligioso.

Recente l’avvio di una collaborazione con l’A.A.P.N. Centro Permanente di Ricerche e Studi sul Presepe Napoletano, per dar vita a una sezione interamente dedicata all’arte presepiale.