Sito al terzo piano di Palazzo Carrati, sede storica dell’Accademia sin dalla sua fondazione, il museo ospita una ricca quadreria, una fototeca, una collezione composta da oggetti di diversa natura nonché alcuni degli strumenti ad arco e a fiato utilizzati dai primi anni di attività dell’Accademia e pervenuti successivamente, dal XVIII sec. 

Il patrimonio museale può essere suddiviso principalmente in due sezioni: la prima è formata dalla quadreria, fototeca ed oggettistica varia e comprende dipinti e fotografie concernenti per lo più personaggi legati all’Accademia (cardinali protettori, musicisti, musicologi, cantanti e strumentisti dal sec. XVII al XX), così come oggetti legati alla loro attività (insegne, gonfalone, strumenti dell’antica cancelleria, effetti personali ecc.). La seconda sezione è rappresentata dalla collezione di strumenti musicali: sono conservati alcuni degli strumenti ad arco ed a fiato utilizzati nei primi anni di attività dell’Accademia (organo Traeri 1673, consort di flauti cinquecenteschi di caratteristiche uniche, cornetto, viola da gamba, liuto) e una discreta quantità di strumenti pervenuti successivamente, dal sec. XVIII ad oggi (viola d’amore, pochette, corno, flauti traversi, clarinetti, vari strumenti a bocchino dell’800, pianoforte Erard appartenuto a S. Golinelli, fortepiano detto “di Rossini”, pianoforte appartenuto a O. Respighi, organo Santoli, vari strumenti ad arco, strumenti etnici ecc.).